特殊食品注册管理司的工作职责：
（一）研究拟订保健食品、婴幼儿配方乳粉产品、特殊医学用途配方食品等特殊食品（以下简称特殊食品）注册管理制度并组织监督实施。（二）研究拟订特殊食品注册管理技术规范并组织实施。（三）研究拟订特殊食品注册审评、注册检验、功能评价、现场核查等工作规范。（四）承担特殊食品注册行政审批和备案管理工作。（五）组织开展与特殊食品注册行政审批、备案管理相关的检查、督导工作。（六）配合相关司局开展特殊食品管理国际交流、生产经营许可、监督管理、稽查办案等工作。 （七）承办总局交办的其他事项。
综合处：
1.承担司综合文稿起草、会议组织、公文处理、文书档案、政务信息、督查督办、安全保密、资产管理等综合工作。
2.组织特殊食品注册管理信息化相关工作。
3.组织特殊食品注册相关技术支撑体系建设。
4.组织对特殊食品注册备案相关工作的检查考核工作。
5.组织研究分析特殊食品注册管理形势、存在问题并提出措施建议。
6.承担特殊食品管理工作的国际、国内交流与合作等工作。
注册一处：
1.组织拟订保健食品注册行政审批和备案管理制度。
2.组织拟订保健食品注册、备案技术规范和工作规范。
3.组织拟订保健食品原料目录和保健功能目录管理制度。
4.承担保健食品注册行政审批、备案管理及指导工作。
5.组织开展与保健食品注册行政审批、备案管理相关的检查、督导工作。
注册二处：
1.组织拟订婴幼儿配方乳粉产品、特殊医学用途配方食品注册管理制度。
2.组织拟订婴幼儿配方乳粉产品、特殊医学用途配方食品注册技术规范和工作规范。
3.承担婴幼儿配方乳粉产品、特殊医学用途配方食品注册行政管理及指导工作。
4.组织开展与婴幼儿配方乳粉产品、特殊医学用途配方食品注册行政审批相关的检查、督导工作。
原文链接：
http://www.sda.gov.cn/WS01/CL0782/128401.html